La cepa de coronavirus de California cada vez más peligrosa

Evade los anticuerpos generados por las vacunas COVID-19 o una infección previa y está asociada con enfermedades graves y la muerte

Cepa de Coronavirus de California: Una variante del coronavirus que surgió a mediados de 2020 y se convirtió en la cepa dominante en California no solo se propaga más fácilmente que sus predecesoras, sino que también evade los anticuerpos generados por las vacunas COVID-19 o una infección previa y está asociada con enfermedades graves y la muerte, según investigadores. dicho.

En un estudio que ayuda a explicar el dramático aumento en el estado de casos y muertes de COVID-19, y presagia más problemas en el futuro, los científicos de UC San Francisco dijeron que el grupo de mutaciones que caracteriza a la cepa local debería marcarla como una «variante de preocupación» en a la par con los del Reino Unido, Sudáfrica y Brasil.

“El diablo ya está aquí”, dijo el Dr. Charles Chiu , quien dirigió el equipo de genetistas, epidemiólogos, estadísticos y otros científicos de la UCSF en un análisis de amplio alcance de la nueva variante, a la que llaman B.1.427 / B.1.429. “Ojalá fuera diferente. Pero la ciencia es la ciencia «.

Los californianos, junto con el resto del país, se han estado preparando para el surgimiento de una variante de coronavirus más transmisible del Reino Unido conocida como B.1.1.7. Pero deben saber que una cepa rival que probablemente sea igual de preocupante ya se ha asentado y probablemente representará el 90% de las infecciones del estado a fines del próximo mes, dijo Chiu, investigadora y médica de enfermedades infecciosas.

Las variantes del Reino Unido y California están armadas con capacidades mejoradas, y la probabilidad de que puedan circular en la misma población aumenta el espectro de un regreso a las infecciones y muertes, dijo Chiu. También abre la puerta a un “escenario de pesadilla”: que los dos virus se encontrarán en una sola persona, intercambiarán sus mutaciones y crearán una cepa aún más peligrosa del virus SARS-CoV-2.

La nueva evidencia de que la variante de California podría hacer que las personas se enfermen más y que las vacunas sean menos efectivas debería impulsar esfuerzos más intensos para reducir las infecciones, dijo Chiu. Esos deberían incluir tanto medidas de salud pública, como enmascaramiento y límites a las actividades públicas, como una campaña de vacunación rápida, agregó.

El nuevo análisis está siendo revisado actualmente por los departamentos de salud pública del condado de San Francisco y el estado, que colaboraron en la nueva investigación. Se espera que se publique a fines de esta semana en MedRxiv, un sitio web que permite compartir nuevas investigaciones antes de su publicación formal.

Durante cinco meses a partir del 1 de septiembre, la cepa de California, que a veces se conoce como 20C / L452R, salió de la oscuridad total para representar más del 50% de todas las muestras de coronavirus que fueron sometidas a análisis genéticos en el estado. En comparación con las cepas que fueron más prominentes aquí a principios del otoño, la nueva cepa parece tener una mayor capacidad de propagación, dijo Chiu.

Exactamente cuánto más transmisible es la cepa de California sigue siendo una pregunta abierta, agregó.

La evidencia de que es más contagioso proviene de varias fuentes.

Las muestras recolectadas de una variedad de condados, y usando una variedad de métodos de recolección, sugieren que la variante es 19% a 24% más transmisible. Pero en algunas circunstancias, su ventaja fue mucho mayor: en un brote en un hogar de ancianos, B.1.427 / B.1.429 se propagó a una tasa seis veces mayor que sus predecesores.

Los investigadores también discernieron patrones uniformes de expansión de la variante en condados de todo el estado. Cuando las tasas de infección aumentaron, por lo general lo hicieron junto con la creciente evidencia de la presencia de la cepa de California.

La mayor propensión a la diseminación de la variante también fue evidente en los resultados de laboratorio. Un análisis de muestras virales de todo el estado mostró que, en comparación con las personas infectadas con otras cepas de SARS-CoV-2, las que estaban infectadas con la cepa de California tenían cargas virales en la nasofaringe que eran dos veces más altas.

Eso, a su vez, hizo que fuera muy probable que cada persona infectada con la nueva cepa infectara a más personas.

El genoma de B.1.427 / B.1.429 incluye tres mutaciones que afectan la proteína de pico crucial, que el virus usa para colarse en las células humanas y convertirlas en fábricas para su propia producción. Una de esas tres mutaciones, denominada L452R, afecta el llamado dominio de unión al receptor, lo que ayuda a que el virus se adhiera más firmemente a las células diana.

Esa adaptación no se ha visto en variantes de coronavirus que han causado preocupación en otros lugares.

En un laboratorio de UCSF, los científicos descubrieron que la mutación L452R por sí sola también hacía que la cepa de California fuera más dañina.

Un coronavirus diseñado para tener solo esa mutación pudo infectar el tejido pulmonar humano al menos un 40% más fácilmente que las variantes circulantes que carecían de la mutación. En comparación con las denominadas cepas de tipo salvaje, el virus modificado fue más de tres veces más infeccioso.

En el laboratorio, la cepa de California también reveló ser más resistente a los anticuerpos neutralizantes generados en respuesta a las vacunas COVID-19, así como a una infección previa por coronavirus.

En comparación con las variantes existentes, la reducción en la protección fue «moderada … pero significativa», dijeron los investigadores.

Cuando los anticuerpos neutralizantes se enfrentaron a la cepa de cosecha propia, su eficacia se redujo a la mitad. En comparación, cuando estos anticuerpos encontraron la cepa de coronavirus que ahora es dominante en Sudáfrica , su efectividad se redujo a una sexta parte de sus niveles habituales.

«Anticipo que con el tiempo tendrá un efecto sobre la vacunación», dijo Chiu. Aunque la magnitud del efecto varió de una muestra a otra y fue menos pronunciada que con la cepa de Sudáfrica, «todavía es preocupante», dijo.

Siniestramente, el nuevo estudio también sugirió que la variante de California podría tener una mayor virulencia.

Esa observación se basa en las historias clínicas de 324 pacientes hospitalizados en UCSF, una muestra relativamente pequeña. Aún así, los investigadores encontraron que el 21% de estos pacientes que estaban infectados con B.1.427 / B.1.429 tenían más probabilidades que sus contrapartes de haber sido admitidos en la UCI, y tenían 11 veces más probabilidades de morir. Ese hallazgo se mantuvo incluso después de que los investigadores ajustaron las diferencias en la edad, el género y la etnia de los pacientes.

Sin embargo, Chiu advierte que este mayor riesgo de muerte puede no ser una señal de que la variante sea inherentemente más letal. Más bien, podría ser simplemente un reflejo de que su mayor transmisibilidad hizo que los hospitales se volvieran tan abrumados y los recursos de atención médica se redujeran tanto que el resultado fueron más muertes, especialmente en el sur de California.

El Dr. Marc Suchard , experto en rastreo de enfermedades infecciosas en UCLA, dijo que algunos de los hallazgos del equipo probablemente se perfeccionarían a medida que se secuenciaran genéticamente más muestras de virus y salieran a la luz más datos.

«Sigue siendo de vital importancia que secuenciamos activamente el virus a medida que se diagnostican casos en nuestro estado», dijo Suchard, que no participó en el trabajo de UCSF. «Me alegra ver tal colaboración entre académicos y departamentos de salud pública en California para identificar el surgimiento de un linaje previamente no identificado».

Esta historia apareció originalmente en Los Angeles Times .

Aprendizaje automático para predecir nuevas cepas de coronavirus, INTELIGENCIA ARTIFICIAL

Los investigadores han utilizado métodos de inteligencia artificial (IA) en un esfuerzo por predecir qué animales podrían desarrollar nuevos tipos de coronavirus que afectan a los humanos.

Predecir nuevas cepas de CORONAVIRUS: Los científicos creen que el nuevo coronavirus que se propaga por todo el mundo, que causa la enfermedad COVID-19, probablemente comenzó en los murciélagos . Luego saltó a otro animal antes de infectar a los humanos.

Una forma de prevenir nuevas pandemias es que los expertos identifiquen qué animales en diferentes partes del mundo tienen más probabilidades de desarrollar coronavirus. Los investigadores involucrados en el estudio dicen que una forma en que se forman los nuevos coronavirus es cuando dos versiones diferentes del virus infectan a un animal.

Cuando esto sucede, el material genético de los virus se “recombina” o se mezcla en una célula. Esto puede resultar en una nueva versión de coronavirus.

La investigación involucró un algoritmo informático que examinó datos sobre la estructura genética de los coronavirus e información sobre diferentes mamíferos. Un algoritmo es un conjunto de pasos que se siguen para completar un proceso informático. Algunos algoritmos funcionan con aprendizaje automático, una forma de IA.

El nuevo estudio identifica una gran cantidad de mamíferos que podrían ser futuros portadores de coronavirus, que pueden infectar tanto a animales como a humanos. Los resultados de la investigación se publicaron recientemente en Nature Communications.

Los cientificos utilizan la inteligencia artificial para predecir el proximo coronavirus

Uno de los investigadores principales del proyecto fue Maya Wardeh.

Trabaja en el Instituto de Infecciones, Ciencias Veterinarias y Ecológicas de la Universidad de Liverpool.

Ella dijo en un comunicado que hasta ahora, no ha habido mucha investigación sobre cómo diferentes mamíferos se ven afectados por diferentes coronavirus.

Pero dicha información «podría ofrecer información sobre dónde podría ocurrir la recombinación viral», agregó Wardeh.

El sistema AI examinó 411 versiones diferentes de coronavirus y 876 posibles especies de mamíferos.

El objetivo era identificar los mamíferos con mayor probabilidad de estar coinfectados y posiblemente portar nuevos coronavirus.

Los resultados sugirieron que hay aproximadamente 11 veces más vínculos entre las especies de mamíferos y las versiones de coronavirus de lo que se había identificado en el pasado. El sistema también predijo 40 veces más especies de mamíferos que pueden infectarse «con cuatro o más (tipos) diferentes de coronavirus de los que se han observado hasta la fecha».

Marcus Blagrove fue codirector de la investigación. Dijo que los resultados del estudio pueden ayudar a los científicos a comprender mejor el nuevo coronavirus, que ya se ha desarrollado en diferentes versiones .

Blagrove señaló que los coronavirus a menudo se recombinan cuando infectan a un huésped y que el nuevo coronavirus es altamente infeccioso para los humanos.

Por lo tanto, la amenaza más inmediata para la salud pública es la recombinación de otros coronavirus con el SARS-CoV-2”, dijo. SARS-CoV-2 es el nombre científico del nuevo coronavirus.

Al observar el coronavirus actual, el equipo dijo que el sistema de aprendizaje automático había identificado hosts en los que podría ocurrir la recombinación de SARS-CoV-2. Predijo al menos 126 especies no humanas en las que se podría encontrar el nuevo coronavirus.

El estudio enumera algunas especies específicas que los científicos pueden observar como posibles huéspedes de coronavirus. Incluyen una especie de murciélago llamado murciélago amarillo asiático menor, que es común en el este de Asia pero no está bien estudiado. Otros fueron el erizo común, el conejo europeo y el gato doméstico.

Los científicos admitieron que los resultados se basaron en datos limitados y dijeron que se necesita más investigación para respaldar los hallazgos.

Sin embargo, señalaron que las pruebas recientes en posibles huéspedes mamíferos para el nuevo coronavirus habían confirmado una serie de predicciones del sistema.

Los resultados podrían usarse para ayudar a descubrir nuevas versiones de coronavirus antes de que pasen de animales a humanos, dijeron los investigadores.

A continuación, planean expandir su investigación para incluir especies de aves para estudiar más a fondo «la gama completa de huéspedes importantes de coronavirus».

Los científicos utilizan la inteligencia artificial para ‘predecir el próximo coronavirus’

Los científicos han utilizado la inteligencia artificial para averiguar dónde puede surgir el próximo nuevo coronavirus.

Coronavirus Inteligencia artificial: El equipo de investigadores utilizó una combinación de aprendizaje automático y biología fundamental, ya que su algoritmo de inteligencia artificial predijo más huéspedes potenciales de cepas de las que se han detectado.

El estudio fue publicado en la revista Nature Communications y el Dr. Marcus Blagrove, virólogo de la Universidad de Liverpool, dijo: «Queremos saber de dónde podría provenir el próximo coronavirus»

Los cientificos utilizan la inteligencia artificial para predecir el proximo coronavirus 1

«Una forma en que se generan es mediante la recombinación entre dos coronavirus existentes, por lo que dos virus infectan la misma célula y se recombinan en un virus ‘hijo’ que sería una cepa completamente nueva».

Al algoritmo se le asignó primero la tarea de encontrar patrones biológicos para predecir qué mamíferos podrían ser susceptibles al coronavirus.

Esto reveló vínculos entre 876 especiales y 411 cepas de coronavirus.

El paso predictivo se centró en los especiales capaces de albergar varios virus.

La Dra. Maya Wardeh, investigadora principal, señaló cómo usó el conocimiento biológico para enseñar a la IA a encontrar patrones.

Ella dijo: «Pudimos predecir qué especies tenían la posibilidad de que muchos coronavirus los infectaran»

«O porque están muy relacionados con una especie que se sabe que porta un coronavirus o porque comparten el mismo espacio geográfico».